Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms