Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF11Q05519 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms