Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN12Q05209 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms