Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN1Q04323 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms