Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRB3Q04118 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB3Q04118 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms