Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms