Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ID3Q02535 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ID3Q02535 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ID3Q02535 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms