Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SP4Q02446 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SP4Q02446 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SP4Q02446 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SP4Q02446 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SP4Q02446 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SP4Q02446 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SP4Q02446 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP4Q02446 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP4Q02446 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SP4Q02446 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP4Q02446 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms