Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms