Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XPCQ01831 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
XPCQ01831 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
XPCQ01831 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XPCQ01831 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
XPCQ01831 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XPCQ01831 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XPCQ01831 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
XPCQ01831 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XPCQ01831 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XPCQ01831 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
XPCQ01831 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XPCQ01831 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
XPCQ01831 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
XPCQ01831 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XPCQ01831 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
XPCQ01831 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XPCQ01831 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms