Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F1Q01094 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms