Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSF1Q00613 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms