Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL1Q00532 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms