Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNAQ00169 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNAQ00169 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms