Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD1P98174 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGD1P98174 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGD1P98174 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGD1P98174 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGD1P98174 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGD1P98174 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGD1P98174 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGD1P98174 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGD1P98174 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGD1P98174 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGD1P98174 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD1P98174 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD1P98174 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD1P98174 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD1P98174 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FGD1P98174 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms