Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED6P86452 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED6P86452 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms