Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFI35P80217 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFI35P80217 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFI35P80217 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFI35P80217 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms