Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN10P78369 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms