Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D3P61077 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms