Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF3EP60228 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms