Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFB3P59826 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPIFB3P59826 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms