Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP11P59045 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP11P59045 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP11P59045 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP11P59045 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP11P59045 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP11P59045 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP11P59045 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms