Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB25P57735 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB25P57735 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB25P57735 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB25P57735 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
RAB25P57735 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB25P57735 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB25P57735 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB25P57735 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms