Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX4P57082 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX4P57082 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX4P57082 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX4P57082 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX4P57082 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX4P57082 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX4P57082 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX4P57082 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX4P57082 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX4P57082 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX4P57082 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX4P57082 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX4P57082 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX4P57082 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX4P57082 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBX4P57082 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBX4P57082 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms