Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK4P57078 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms