Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L1P55209 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms