Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKAP1LP55160 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms