Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23BP54727 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms