Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN3P54252 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms