Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 PTPN4-211ENST00000488279 662 ntTSL 536.14■■■■□ 3.381e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 433.95■■■■□ 3.031e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 PTPN4-210ENST00000485247 590 ntTSL 38.91□□□□□ -0.981e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 220.44■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 C3-204ENST00000594936 625 ntTSL 224.17■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 C3-213ENST00000600744 708 ntTSL 523.69■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 235.25■■■■□ 3.239e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.049e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 UBA2-206ENST00000591016 646 ntTSL 25.89□□□□□ -1.479e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 TBCD-205ENST00000571618 775 ntTSL 317.35■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 321.39■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 233.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 433.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 533.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 433.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 333.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 433.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 433.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 533.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 433.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 433.83■■■■□ 3.011e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 431.18■■■□□ 2.581e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 526.96■■□□□ 1.911e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 APLP2-211ENST00000529235 537 ntTSL 423.42■■□□□ 1.341e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 UGT2B7-202ENST00000502942 866 ntTSL 212.75□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 UGT2B7-204ENST00000509763 744 ntTSL 56.31□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)8.39□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MSI2-209ENST00000579483 5141 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NCOA1-211ENST00000496333 501 ntTSL 326.96■■□□□ 1.915e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.925e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 233.15■■■□□ 2.92e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 NBAS-204ENST00000427792 442 ntTSL 23.56□□□□□ -1.848e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KANSL1-214ENST00000576739 592 ntTSL 234.57■■■■□ 3.129e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 412.07□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.093e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.85e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 535.02■■■■□ 3.24e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.932e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-213ENST00000482138 588 ntTSL 433.07■■■□□ 2.884e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-215ENST00000493074 627 ntTSL 433.07■■■□□ 2.884e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 332.61■■■□□ 2.814e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.812e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-206ENST00000461813 587 ntTSL 430.84■■■□□ 2.534e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 430.84■■■□□ 2.534e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 230.75■■■□□ 2.515e-16■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 430.16■■■□□ 2.424e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 328.71■■■□□ 2.195e-16■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 428.33■■■□□ 2.134e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-207ENST00000468001 613 ntTSL 328.07■■■□□ 2.084e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.072e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-210ENST00000475827 545 ntTSL 424.86■■□□□ 1.574e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 EIPR1-209ENST00000462515 577 ntTSL 324.55■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.334e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.915e-16■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.835e-16■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 UBE3C-203ENST00000430750 448 ntTSL 418.15■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.15e-16■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-11■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TTL-202ENST00000460450 4148 ntTSL 211.72□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 163 ms