Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRCA2P51587 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms