Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms