Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX5P50542 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX5P50542 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX5P50542 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX5P50542 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX5P50542 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX5P50542 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX5P50542 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX5P50542 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms