Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CX3CR1P49238 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CX3CR1P49238 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms