Protein–RNA interactions for Protein: P48454

PPP3CC, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CCP48454 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CCP48454 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP3CCP48454 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CCP48454 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms