Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARCN1P48444 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARCN1P48444 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms