Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTX2P47972 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPTX2P47972 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms