Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP5P45974 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP5P45974 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP5P45974 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP5P45974 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP5P45974 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP5P45974 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP5P45974 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP5P45974 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP5P45974 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms