Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP13P45452 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP13P45452 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP13P45452 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP13P45452 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP13P45452 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP13P45452 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP13P45452 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP13P45452 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms