Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSG1P42857 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSG1P42857 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSG1P42857 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSG1P42857 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NSG1P42857 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSG1P42857 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSG1P42857 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSG1P42857 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSG1P42857 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSG1P42857 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms