Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR1BP42025 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR1BP42025 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR1BP42025 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR1BP42025 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR1BP42025 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR1BP42025 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR1BP42025 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR1BP42025 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR1BP42025 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms