Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK3P41970 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK3P41970 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK3P41970 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK3P41970 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELK3P41970 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELK3P41970 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELK3P41970 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK3P41970 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK3P41970 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK3P41970 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELK3P41970 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms