Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 MMS2YGL087C 414 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YKR047WYKR047W 306 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 MOH1YBL049W 417 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 NCE103YNL036W 666 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 REX4YOL080C 870 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YPR015CYPR015C 744 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 ANT1YPR128C 987 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YRB30YGL164C 1323 nt3.88□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 SPT10YJL127C 1923 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 SEG1YMR086W 2883 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 GEM1YAL048C 1989 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 MRH4YGL064C 1686 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 CNA1YLR433C 1662 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 PUF2YPR042C 3228 nt3.87□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 SNT1YCR033W 3681 nt3.86□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 ERV14YGL054C 417 nt3.86□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YIL152WYIL152W 708 nt3.86□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 ALA1YOR335C 2877 nt3.85□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 AGA1YNR044W 2178 nt3.85□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 MNT4YNR059W 1743 nt3.85□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 UPS2YLR168C 693 nt3.85□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 DAN4YJR151C 3486 nt3.85□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YRM1YOR172W 2361 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 RPS14AYCR031C 414 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 RPS8BYER102W 603 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 YGR015CYGR015C 987 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 FOL2YGR267C 732 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 PSR1YLL010C 1284 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 RPS8AYBL072C 603 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 WRS1YOL097C 1299 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 POC4YPL144W 447 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 CMR3YPR013C 954 nt3.84□□□□□ -1.79
SHQ1P40486 GPI10YGL142C 1851 nt3.84□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 RIM4YHL024W 2142 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 NFI1YOR156C 2181 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 NOP6YDL213C 678 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 MRM2YGL136C 963 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 DAN1YJR150C 897 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 IES3YLR052W 753 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YLR402WYLR402W 192 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 IDH2YOR136W 1110 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 PEP7YDR323C 1548 nt3.83□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 VPS53YJL029C 2469 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 KIN3YAR018C 1308 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 MRT4YKL009W 711 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 MBR1YKL093W 1020 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YML053CYML053C 639 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 FOL3YMR113W 1284 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 SHH3YMR118C 591 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 MTR4YJL050W 3222 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 CTF18YMR078C 2226 nt3.82□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 APL4YPR029C 2499 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 HER2YMR293C 1395 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 COS7YDL248W 1152 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 GLC3YEL011W 2115 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 FMP10YER182W 735 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YGR273CYGR273C 525 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 COS5YJR161C 1152 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YKR075CYKR075C 924 nt3.81□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 MRS2YOR334W 1413 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 AIM26YKL037W 357 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 TMA19YKL056C 504 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 ARG80YMR042W 534 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YMR084WYMR084W 789 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 IMP1YMR150C 573 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YPL168WYPL168W 1293 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 GPI13YLL031C 3054 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 TAF6YGL112C 1551 nt3.8□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 NAM9YNL137C 1461 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 TRM13YOL125W 1431 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 NUP159YIL115C 4383 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 RTT109YLL002W 1311 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YDR391CYDR391C 699 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 ANB1YJR047C 474 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 VPS71YML041C 843 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 PRX1YBL064C 786 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 RPL18AYOL120C 561 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YBR137WYBR137W 540 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 MUP3YHL036W 1641 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 SLM5YCR024C 1479 nt3.79□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YOL019WYOL019W 1656 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 JEN1YKL217W 1851 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 SPO1YNL012W 1896 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 PRP11YDL043C 801 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 NUS1YDL193W 1128 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 RPA14YDR156W 414 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 SNL1YIL016W 480 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 ENT3YJR125C 1227 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 JLP1YLL057C 1239 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 RIB4YOL143C 510 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 APP1YNL094W 1764 nt3.78□□□□□ -1.8
SHQ1P40486 STU1YBL034C 4542 nt3.78□□□□□ -1.81
SHQ1P40486 PUB1YNL016W 1362 nt3.77□□□□□ -1.81
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