Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP62P37198 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP62P37198 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP62P37198 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP62P37198 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms