Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL4P36578 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL4P36578 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPL4P36578 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
RPL4P36578 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL4P36578 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL4P36578 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms