Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK1P35558 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK1P35558 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK1P35558 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK1P35558 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK1P35558 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK1P35558 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK1P35558 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK1P35558 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK1P35558 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK1P35558 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK1P35558 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK1P35558 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK1P35558 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK1P35558 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK1P35558 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK1P35558 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms