Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms