Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCD1P33897 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD1P33897 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD1P33897 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms