Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP2P32456 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP2P32456 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP2P32456 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP2P32456 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP2P32456 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP2P32456 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP2P32456 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP2P32456 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP2P32456 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP2P32456 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP2P32456 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP2P32456 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP2P32456 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms