Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP1P32455 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP1P32455 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP1P32455 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms